С 1986 года школа взяла курс на педагогику сотрудничества и развитие интереса к предметам.
В 1990 году появились сквозные факультативы – пропедевтика спецкурсов.
С 1994 года функционируют шесть спецкурсов: физика, математика, химия, биология, история, литература. Стабильно начал работу физико–математический класс.
В 1996 году средняя школа №2 – победитель Всероссийского конкурса «Школа года». Организован биологический класс, а позже гуманитарный.
В 2001 году прошла областная аттестация школы, и ей был присвоен новый статус – лицей. Стали функционировать три профиля: физико-математический, химико-биологический и гуманитарный.
В 2002 году лицей – победитель Всероссийского конкурса «Школа года».
2004 год. Лицей стал лауреатом областного конкурса «Лучшие школы России».
2005 год. Подтвержден статус лицея на областной аттестации.